MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 50717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015562	GCA	2	6	180191	180196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910066
5002	NC_015562	ATG	2	6	180342	180347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910066
5003	NC_015562	A	6	6	180425	180430	100 %	0 %	0 %	0 %	333910066
5004	NC_015562	TA	3	6	180442	180447	50 %	50 %	0 %	0 %	333910066
5005	NC_015562	A	6	6	180458	180463	100 %	0 %	0 %	0 %	333910066
5006	NC_015562	ATT	2	6	180472	180477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910066
5007	NC_015562	TTG	2	6	180593	180598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910066
5008	NC_015562	TA	3	6	180617	180622	50 %	50 %	0 %	0 %	333910066
5009	NC_015562	AG	3	6	180698	180703	50 %	0 %	50 %	0 %	333910066
5010	NC_015562	AATTGA	2	12	180706	180717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333910066
5011	NC_015562	CTATA	2	10	180862	180871	40 %	40 %	0 %	20 %	333910066
5012	NC_015562	TGA	2	6	180925	180930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910066
5013	NC_015562	AGG	2	6	180948	180953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910066
5014	NC_015562	CTC	2	6	180985	180990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910066
5015	NC_015562	AT	3	6	181163	181168	50 %	50 %	0 %	0 %	333910066
5016	NC_015562	AGTT	2	8	181227	181234	25 %	50 %	25 %	0 %	333910066
5017	NC_015562	GA	4	8	181245	181252	50 %	0 %	50 %	0 %	333910066
5018	NC_015562	AG	3	6	181253	181258	50 %	0 %	50 %	0 %	333910066
5019	NC_015562	AAGAA	2	10	181281	181290	80 %	0 %	20 %	0 %	333910066
5020	NC_015562	GTT	2	6	181301	181306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910066
5021	NC_015562	GAT	2	6	181309	181314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910066
5022	NC_015562	TGA	2	6	181323	181328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910066
5023	NC_015562	TTG	2	6	181353	181358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910066
5024	NC_015562	ATG	2	6	181374	181379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910066
5025	NC_015562	TCA	2	6	181397	181402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910066
5026	NC_015562	TGGA	2	8	181417	181424	25 %	25 %	50 %	0 %	333910066
5027	NC_015562	ATA	2	6	181479	181484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910066
5028	NC_015562	GTG	3	9	181486	181494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910066
5029	NC_015562	GTG	2	6	181546	181551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910066
5030	NC_015562	A	6	6	181608	181613	100 %	0 %	0 %	0 %	333910067
5031	NC_015562	GAT	2	6	181626	181631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910067
5032	NC_015562	TAT	2	6	181643	181648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910067
5033	NC_015562	GAG	2	6	181652	181657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910067
5034	NC_015562	T	6	6	181668	181673	0 %	100 %	0 %	0 %	333910067
5035	NC_015562	AAAAT	2	10	181711	181720	80 %	20 %	0 %	0 %	333910067
5036	NC_015562	TGT	2	6	181754	181759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910067
5037	NC_015562	CTG	2	6	181765	181770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910067
5038	NC_015562	TG	3	6	181789	181794	0 %	50 %	50 %	0 %	333910067
5039	NC_015562	AAAT	2	8	181819	181826	75 %	25 %	0 %	0 %	333910067
5040	NC_015562	AT	3	6	181841	181846	50 %	50 %	0 %	0 %	333910067
5041	NC_015562	AT	3	6	181885	181890	50 %	50 %	0 %	0 %	333910067
5042	NC_015562	GAG	2	6	181932	181937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910067
5043	NC_015562	ATT	2	6	181957	181962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910067
5044	NC_015562	GA	3	6	181984	181989	50 %	0 %	50 %	0 %	333910067
5045	NC_015562	GTT	2	6	181991	181996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910067
5046	NC_015562	CTT	2	6	182072	182077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910067
5047	NC_015562	AGTT	2	8	182161	182168	25 %	50 %	25 %	0 %	333910067
5048	NC_015562	TAC	2	6	182209	182214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910067
5049	NC_015562	TGG	2	6	182219	182224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910067
5050	NC_015562	AGTA	2	8	182234	182241	50 %	25 %	25 %	0 %	333910067
5051	NC_015562	TTAA	2	8	182292	182299	50 %	50 %	0 %	0 %	333910067
5052	NC_015562	A	6	6	182364	182369	100 %	0 %	0 %	0 %	333910067
5053	NC_015562	A	6	6	182426	182431	100 %	0 %	0 %	0 %	333910067
5054	NC_015562	ATA	2	6	182444	182449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910067
5055	NC_015562	A	6	6	182453	182458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015562	AG	3	6	182481	182486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015562	A	6	6	182487	182492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015562	AGA	2	6	182507	182512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015562	TTCA	2	8	182660	182667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_015562	TA	3	6	182676	182681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015562	TAA	2	6	182824	182829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910068
5062	NC_015562	GA	3	6	182850	182855	50 %	0 %	50 %	0 %	333910068
5063	NC_015562	GAG	2	6	183047	183052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910068
5064	NC_015562	AGGA	2	8	183211	183218	50 %	0 %	50 %	0 %	333910068
5065	NC_015562	TGA	2	6	183260	183265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910068
5066	NC_015562	A	6	6	183288	183293	100 %	0 %	0 %	0 %	333910068
5067	NC_015562	AGTT	2	8	183310	183317	25 %	50 %	25 %	0 %	333910068
5068	NC_015562	GAGGG	2	10	183320	183329	20 %	0 %	80 %	0 %	333910068
5069	NC_015562	GA	3	6	183354	183359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015562	GAT	2	6	183384	183389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_015562	ATA	2	6	183400	183405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015562	T	6	6	183425	183430	0 %	100 %	0 %	0 %	333910069
5073	NC_015562	AG	3	6	183434	183439	50 %	0 %	50 %	0 %	333910069
5074	NC_015562	GAT	2	6	183482	183487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910069
5075	NC_015562	ATTT	2	8	183488	183495	25 %	75 %	0 %	0 %	333910069
5076	NC_015562	TAA	2	6	183531	183536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910069
5077	NC_015562	ATA	2	6	183542	183547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910069
5078	NC_015562	A	7	7	183559	183565	100 %	0 %	0 %	0 %	333910069
5079	NC_015562	A	6	6	183572	183577	100 %	0 %	0 %	0 %	333910069
5080	NC_015562	AT	3	6	183612	183617	50 %	50 %	0 %	0 %	333910069
5081	NC_015562	TGA	2	6	183655	183660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910069
5082	NC_015562	AGA	2	6	183667	183672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910069
5083	NC_015562	AT	3	6	183688	183693	50 %	50 %	0 %	0 %	333910069
5084	NC_015562	AG	3	6	183694	183699	50 %	0 %	50 %	0 %	333910069
5085	NC_015562	TAT	2	6	183734	183739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910069
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5089	NC_015562	TTAT	2	8	183824	183831	25 %	75 %	0 %	0 %	333910069
5090	NC_015562	AAG	2	6	183842	183847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910069
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5093	NC_015562	AG	3	6	183961	183966	50 %	0 %	50 %	0 %	333910069
5094	NC_015562	GTTT	2	8	184002	184009	0 %	75 %	25 %	0 %	333910069
5095	NC_015562	GAAG	2	8	184040	184047	50 %	0 %	50 %	0 %	333910069
5096	NC_015562	GAT	2	6	184067	184072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910069
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5098	NC_015562	TAAA	2	8	184125	184132	75 %	25 %	0 %	0 %	333910069
5099	NC_015562	AG	3	6	184151	184156	50 %	0 %	50 %	0 %	333910069
5100	NC_015562	AGG	2	6	184174	184179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910069
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5102	NC_015562	GAA	2	6	184208	184213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910069
5103	NC_015562	GA	3	6	184231	184236	50 %	0 %	50 %	0 %	333910069
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5107	NC_015562	A	7	7	184322	184328	100 %	0 %	0 %	0 %	333910069
5108	NC_015562	AAT	2	6	184378	184383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910069
5109	NC_015562	A	7	7	184388	184394	100 %	0 %	0 %	0 %	333910069
5110	NC_015562	AG	3	6	184397	184402	50 %	0 %	50 %	0 %	333910069
5111	NC_015562	A	6	6	184539	184544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015562	GCA	2	6	184567	184572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910070
5113	NC_015562	T	6	6	184579	184584	0 %	100 %	0 %	0 %	333910070
5114	NC_015562	T	6	6	184666	184671	0 %	100 %	0 %	0 %	333910070
5115	NC_015562	T	7	7	184743	184749	0 %	100 %	0 %	0 %	333910070
5116	NC_015562	T	6	6	184779	184784	0 %	100 %	0 %	0 %	333910070
5117	NC_015562	AAT	2	6	184788	184793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910070
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5119	NC_015562	AT	3	6	184874	184879	50 %	50 %	0 %	0 %	333910070
5120	NC_015562	TTA	2	6	184931	184936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910070
5121	NC_015562	ATA	2	6	184982	184987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910070
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